Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3173A6NAS3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms