Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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