Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Siah1bQ06985 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms