Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms