Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VarsQ9Z1Q9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VarsQ9Z1Q9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms