Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pus1Q9WU56 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pus1Q9WU56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pus1Q9WU56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms