Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pgpep1Q9ESW8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pgpep1Q9ESW8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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