Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx5Q9D8U8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms