Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtpbp8Q9CY28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Gtpbp8Q9CY28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gtpbp8Q9CY28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp8Q9CY28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms