Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pfdn1Q9CWM4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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