Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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