Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RSG1Q9BU20 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms