Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim3Q99PE5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms