Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab27bQ99P58 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab27bQ99P58 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms