Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spef1Q99JL1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spef1Q99JL1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms