Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX2Q99697 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms