Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atl3Q91YH5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atl3Q91YH5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms