Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng8Q8VHW2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacng8Q8VHW2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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