Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc3Q8R5M0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc3Q8R5M0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms