Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPM2Q86SE8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms