Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp397Q7TNK4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp397Q7TNK4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms