Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SvoplQ6PDF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SvoplQ6PDF3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms