Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms