Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phox2aQ62066 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phox2aQ62066 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phox2aQ62066 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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