Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd28Q505D1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd28Q505D1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd28Q505D1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd28Q505D1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd28Q505D1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ankrd28Q505D1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd28Q505D1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms