Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox9Q04887 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms