Protein–RNA interactions for Protein: Q02013

Aqp1, Aquaporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp1Q02013 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Aqp1Q02013 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp1Q02013 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms