Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3aP97351 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3aP97351 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms