Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms