Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms