Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms