Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf1P46099 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms