Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 MNL1YHR204W 2391 nt4.64□□□□□ -1.67
GEF1P37020 BIK1YCL029C 1323 nt4.64□□□□□ -1.67
GEF1P37020 GRS2YPR081C 1857 nt4.64□□□□□ -1.67
GEF1P37020 TAF7YMR227C 1773 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 SLP1YOR154W 1764 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 UTP13YLR222C 2454 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YLR269CYLR269C 351 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YBR032WYBR032W 303 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 MIS1YBR084W 2928 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 VID28YIL017C 2766 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 GSC2YGR032W 5688 nt4.63□□□□□ -1.67
GEF1P37020 ECM16YMR128W 3804 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YER068C-AYER068C-A 432 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 IGO2YHR132W-A 396 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 TVP18YMR071C 504 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YOL134CYOL134C 390 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 HSP10YOR020C 321 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 MES1YGR264C 2256 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 SPT23YKL020C 3249 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 OLE1YGL055W 1533 nt4.62□□□□□ -1.67
GEF1P37020 GPI17YDR434W 1605 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 HOYDL227C 1761 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 PHM6YDR281C 315 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YER038W-AYER038W-A 381 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 LSM1YJL124C 519 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 RPL14AYKL006W 417 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 FLD1YLR404W 858 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YNL146WYNL146W 303 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 RPS23BYPR132W 438 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YPR197CYPR197C 564 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 BRE4YDL231C 3378 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 SNF2YOR290C 5112 nt4.61□□□□□ -1.67
GEF1P37020 IOC2YLR095C 2439 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 RPS13YDR064W 456 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 RPB9YGL070C 369 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YPS5YGL259W 498 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 HIT1YJR055W 495 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YLR302CYLR302C 363 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 RAD14YMR201C 1116 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 HHT2YNL031C 411 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 RPL23AYBL087C 414 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 SEC15YGL233W 2733 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 ALY1YKR021W 2748 nt4.6□□□□□ -1.67
GEF1P37020 REG1YDR028C 3045 nt4.59□□□□□ -1.67
GEF1P37020 TCB3YML072C 4638 nt4.59□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.59□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YBL071CYBL071C 309 nt4.59□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YPL080CYPL080C 327 nt4.59□□□□□ -1.67
GEF1P37020 GDT1YBR187W 843 nt4.59□□□□□ -1.67
GEF1P37020 YCG1YDR325W 3108 nt4.59□□□□□ -1.68
GEF1P37020 SYT1YPR095C 3681 nt4.58□□□□□ -1.68
GEF1P37020 IES6YEL044W 501 nt4.58□□□□□ -1.68
GEF1P37020 CRG1YHR209W 876 nt4.58□□□□□ -1.68
GEF1P37020 BSC3YLR465C 309 nt4.58□□□□□ -1.68
GEF1P37020 PFY1YOR122C 381 nt4.58□□□□□ -1.68
GEF1P37020 SEC22YLR268W 645 nt4.57□□□□□ -1.68
GEF1P37020 YNR063WYNR063W 1824 nt4.57□□□□□ -1.68
GEF1P37020 VBA4YDR119W 2307 nt4.57□□□□□ -1.68
GEF1P37020 FAA2YER015W 2235 nt4.56□□□□□ -1.68
GEF1P37020 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt4.56□□□□□ -1.68
GEF1P37020 SOL4YGR248W 768 nt4.56□□□□□ -1.68
GEF1P37020 RPS20YHL015W 366 nt4.56□□□□□ -1.68
GEF1P37020 MNT3YIL014W 1893 nt4.56□□□□□ -1.68
GEF1P37020 KAP114YGL241W 3015 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 RPL29YFR032C-A 180 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 LIF1YGL090W 1266 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 RNP1YLL046C 750 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 TEN1YLR010C 483 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 YLR230WYLR230W 306 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 YSY6YBR162W-A 198 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 YLR001CYLR001C 2589 nt4.55□□□□□ -1.68
GEF1P37020 ARK1YNL020C 1917 nt4.54□□□□□ -1.68
GEF1P37020 JEN1YKL217W 1851 nt4.54□□□□□ -1.68
GEF1P37020 RNR1YER070W 2667 nt4.54□□□□□ -1.68
GEF1P37020 YOL150CYOL150C 312 nt4.54□□□□□ -1.68
GEF1P37020 VHS3YOR054C 2025 nt4.54□□□□□ -1.68
GEF1P37020 RAD4YER162C 2265 nt4.53□□□□□ -1.68
GEF1P37020 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.53□□□□□ -1.68
GEF1P37020 STN1YDR082W 1485 nt4.53□□□□□ -1.68
GEF1P37020 BNI4YNL233W 2679 nt4.53□□□□□ -1.68
GEF1P37020 SKN7YHR206W 1869 nt4.52□□□□□ -1.69
GEF1P37020 RNH70YGR276C 1662 nt4.52□□□□□ -1.69
GEF1P37020 YJR030CYJR030C 2238 nt4.52□□□□□ -1.69
GEF1P37020 VOA1YGR106C 798 nt4.52□□□□□ -1.69
GEF1P37020 LAG1YHL003C 1236 nt4.52□□□□□ -1.69
GEF1P37020 YPL039WYPL039W 951 nt4.52□□□□□ -1.69
GEF1P37020 MSH2YOL090W 2895 nt4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms