Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms