Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18530 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18530 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P18530 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18530 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18530 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18530 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18530 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P18530 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms