Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COX6A1P12074 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COX6A1P12074 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COX6A1P12074 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COX6A1P12074 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COX6A1P12074 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COX6A1P12074 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COX6A1P12074 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COX6A1P12074 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms