Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALM3P0DP25 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms