Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sp100O35892 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sp100O35892 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sp100O35892 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sp100O35892 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sp100O35892 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sp100O35892 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sp100O35892 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp100O35892 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sp100O35892 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sp100O35892 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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