Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm379J3QQ19 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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