Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r68E9Q0V3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms