Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms