Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r5B2RQT2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms