Protein–RNA interactions for Protein: A0JLX3

Smok4a, Sperm motility kinase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok4aA0JLX3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smok4aA0JLX3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smok4aA0JLX3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms