Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Top2aQ01320 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms