Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D17h6s53eQ9Z1R4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms