Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2IPQ9Y2D8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2IPQ9Y2D8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms