Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp16Q9WTR0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp16Q9WTR0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms