Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC9Q9UKV0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms