Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms