Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5oQ9DB20 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5oQ9DB20 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms